Objectif 1 : le diagnostique

Le premier objectif de la Chaire est de confirmer que le score Interféron de type I représente un marqueur universel des infections virales respiratoires. Pour cela, les Hospices civils de Lyon vont recueillir 1000 écouvillons nasopharyngés parmi leurs patients hospitalisés, sur lesquels les performances de ce nouveau test IFN-I pour diagnostiquer les infections virales vont être évaluées. Afin d’être exhaustif sur les infections virales, le même type d’étude va être réalisée sur trois autres continents (Afrique, Amérique du Sud et Asie du Sud-Est).Le caractère universel du marqueur pourra ainsi être confirmé.

La capacité du score IFN-I à distinguer les infections virales actives (dites réplicatives) va également être testée dans cet axe de recherche. Pour cela, grâce à la collection d’échantillons provenant des HCL, nous pourrons déterminer un seuil de réponse à l’IFN, dans les écouvillons nasopharyngés, reflétant le caractère réplicatif de l’infection en cours. . Il sera possible d’affiner ce seuil associé à une réplication virale grâce à des méthodes ex-vivo  qui permettront par exemple d’exposer l’épithélium des voies respiratoires humaines à des virus inactivés (inactivation thermique ou traitement UV).